Gimė 1964 07 24 Vajasiškio kaime, Zarasų rajone. Gamtos mokslų daktaras, Vilniaus universiteto Ekologijos instituto Jūros ekologijos laboratorijos mokslo mokslinis bendradarbis. Baigęs Dusetų Kazimiero Būgos vidurinę mokyklą mokslus tęsė Vilniaus Pedagoginiame institute, kur įsigijo biologijos ir žemės ūkio pagrindų mokytojo specialybę ir tais pačiais metais tapo Lietuvos Mokslų Akademijos Zoologijos ir parazitologijos instituto vyresniuoju laborantu, vėliau dirbo Ekologijos instituto vyresniuoju laborantu, nuo 1993 m. – mokslinių bendradarbiu. Apginė ekologijos disertacinį darbą “Aukštesniųjų kompleksų formavimas Lietuvos vandenyse ir jų reikšmė biocenozėse”. Disertacijoje aprašė introdukuotų 50-yje Lietuvos ežerų Ponto Kaspijos vėžiagyvių inventorizacijos rezultatus. Paskelbė apie 20 mokslinių straipsnių ir pranešimų, išleido knygų lietuvių ir anglų kalbomis. Skaitė pranešimus mokslininkų renginiuose Lietuvoje, Rusijoje ir Latvijoje, dalyvavo kompleksinėje mokslininkų ekspedicijoje Azovo jūroje. 1997 m. Gintautui Vaitoniui paskirta valstybės stipendija jauniesiems mokslininkams remti. G. Vaitonis yra Lietuvos hidrobiologų draugijos ir valdybos, EMIN’ o (Europos tarptautinių jūrinių tyrimų tinklas) organizacijos, Lietuvos ekologų draugijos narys.
http://www.leu.lt/lt/kontaktai/gintautas_vaitonis