Gimė 1884 m. vasario 5 d. Madagaskaro kaime Zarasų apskrityje. (Dabar Daugailių parapija, Utenos apskritis. Katalikų dvasininkas, arkivyskupas, teologijos ir filosofijos profesorius, diplomatas, politikas, Lietuvos užsienio reikalų ministras, SSRS politinis kalinys, kankinys.
Mokėsi Antalieptės ir Mūrinės Ašmenos (Vilniuje) pradžios mokyklose. 1900 m. Rygoje aukso medaliu baigė gimnaziją ir kitais metais įstojo į Vilniaus kunigų seminariją. 1905 m. ją baigęs, studijas tęsė Peterburgo dvasinėje akademijoje. 1907 m. įšventintas kunigu. 1909–1912 m. studijas gilino Belgijos Filosofijos institute prie Liuveno universiteto. Studijavo filosofiją, teologiją, gamtos mokslus ir psichologiją, apginė filosofijos mokslų daktaro laipsnį. 1913–1914 m. Strasbūro universiteto Teologijos fakultete studijavo apologetiką. 1922 – 1940 dėstė psichologiją, Vytauto Didžiojo universiteto Teologijos ir filosofijos ekstraordinarinis profesorius, 1916–22 dėstė filosofiją Vilniaus kunigų seminarijoje, 1922–40 psichologiją Kauno universitete. Vienas iš Lietuvių katalikų mokslo akademijos steigėjų ir pirmasis jos sekretorius (1922). Mokėjo lotynų, italų, prancūzų, anglų, danų vokiečių, rusų, lenkų, ispanų kalbas. 1925 09 25–1926 04 21 Ministrų kabineto Užsienio reikalų ministras. 1926 įšventintas vyskupu ir paskirtas Vilkaviškio vyskupo pagalbininku. 1942–1947 Vilniaus vyskupas, nuo 1942 t. p. Minskio ir Mogiliovo arkivyskupijos valdytojas. Bendradarbiavo žurnaluose ,,Naujoji Lietuva“, ,,XX amžius“, ,,Židinys“, ,,Logos“, ,,Soter“, ,,Laisvoji Lietuva“, Lietuvių katalikų mokslo akademijos leidinyje ,,Suvažiavimo darbai“ ir kt. Reiškėsi ateitininkų, pavasarininkų, krikščionių demokratų partijos veikloje (parašė šios partijos naują programą (1947). 1947 m. birželio 12 d. sovietų suimtas. Mirė 1953 m. lapkričio 8 d. Vladimiro kalėjime, Rusijoje. Simbolinis karstas su sauja žemių iš Vladimiro yra Vilniaus Arkikatedros vyskupų kriptoje. Prie tėviškės kelio pastatytas arkivyskupo kryžius (fundatoriai: kraštotyrininko A. Žilėno vadovaujamas kultūros fondo Zarasų skyrius, Antalieptės bendrovė, vadovaujama D. Popovo, (Antalieptės parapija).
50 metų, kai užgeso arkivyskupo Mečislovo Reinio gyvybė / Jonas Namanis // Zarasų kraštas.- 2003, lapkr. 7, p. 2